Análisis Estructural y Funcional de Macromoléculas – Betina Córsico, Lisandro J. Falomir Lockhart, Gisela R. Franchini, Natalia Scaglia – 1ra Edición

Análisis Estructural y Funcional de Macromoléculas

Por: / Gisela R. Franchini / Lisandro J. Falomir Lockhart / Natalia Scaglia

Descripción

Este libro tiene como objetivo motivar a estudiantes y profesores en el campo de la bioquímica y disciplinas relacionadas a explorar un conjunto de metodologías modernas aplicadas a la comprensión de los principios moleculares detrás de los procesos biológicos, especialmente aquellos relacionados con las proteínas.

Desde los años 90, con el surgimiento de la genómica y proteómica, se ha identificado un gran número de proteínas para las cuales solo se conoce su estructura primaria. Para avanzar en la caracterización estructural y funcional de estas proteínas, se han requerido diversas herramientas bioquímicas y biofísicas.

En la actualidad, los límites entre las diferentes disciplinas de las ciencias naturales se han vuelto difusos, y se necesita una visión integral proporcionada por la biofisicoquímica, que abarque las técnicas complementarias disponibles en la actualidad.

  1. Prefacio
  2. Parte I – Caracterización de Proteínas. Técnicas de Baja Resolución
    1. Capítulo 1. Técnicas bioquímicas para el estudio de proteínas
      1. Técnicas Electroforéticas
      2. Cromatografía de Permeación por Geles
      3. Ultracentrifugación Analítica
    2. Capítulo 2. Fluorescencia
      1. Fenómenos Luminiscentes
      2. Espectrometría de Fluorescencia
      3. Anisotropía
      4. Quenching de la Fluorescencia
      5. Fenómeno de Transferencia de Energía de Resonancia Föster (FRET)
      6. Sondas Fluorescentes
    3. Capítulo 3. Espectroscopía infrarroja en el estudio de proteínas y membranas lipídicas
      1. Introducción y Fundamentos
      2. Instrumentación
      3. FTIR de Proteínas: Estructura Secundaria y Dinámica
      4. FTIR de Lípidos
    4. Capítulo 4. Dicroísmo circular de péptidos y proteínas
      1. La naturaleza de la luz polarizada
      2. Relación entre luz plana y circularmente polarizada
      3. Interacción de la luz polarizada con la materia
      4. Condiciones físicas para CD
      5. Efecto Cotton (ORD/CD)
      6. Instrumentación y práctica para medición de CD
      7. Valor de CD para investigar la conformación de péptidos y proteínas
      8. Región UV Lejana y estructura secundaria
      9. Estimación del contenido de estructura secundaria
      10. Región UV Cercana y estructura terciaria
      11. Cambios conformacionales en proteínas
      12. Interacción proteína-ligando
      13. Efecto de anfifilos y co-solventes sobre péptidos desestructurados
  3. Parte II – Métodos de Alta Resolución para el Estudio Estructural de Proteínas
    1. Capítulo 5. Cálculos computacionales en macromoléculas biológicas
      1. Orígenes
      2. Modelo inicial
      3. Estudios computacionales de estructura biomolecular
      4. Modelo y energía
      5. Electrostática de macromoléculas
      6. Dinámica de macromoléculas
    2. Capítulo 6. Resolución de estructuras de proteínas por cristalografía de rayos X
      1. Breve repaso histórico
      2. Por qué rayos X y por qué cristales
      3. Cristalización de la proteína
      4. Colección de datos de difracción
      5. Mapa de densidad electrónica de la proteína
      6. Ajuste de la secuencia de aminoácidos al mapa
      7. Resolución
      8. Refinamiento
      9. Validación
      10. Herramientas computacionales para resolver una estructura cristalográfica
    3. Capítulo 7. Resonancia magnética nuclear (RMN)
      1. Fundamentos
      2. Espectrómetro
      3. Parámetros espectrales
      4. Cómo se obtiene un espectro
      5. Ejemplo práctico: determinación de estructura
      6. Aplicaciones
  4. Parte III – Caracterización Biofísica de Lípidos y Membranas y sus interacciones con Proteínas
    1. Capítulo 8. Interacción de lípidos con el agua y formación de estructuras empaquetadas
      1. Interacción hidrofóbica y polimorfismo lipídico
      2. Monocapas
      3. Micelas
      4. Micelas invertidas
      5. Bicapas
      6. Membranas modelo
    2. Capítulo 9. Interacción lípido-proteína
      1. Lípidos en la estabilización y regulación de proteínas
      2. Estrategias para el estudio de interacciones lípido-proteína
    3. Capítulo 10. Técnicas biofísicas para el estudio de lípidos y membranas
      1. Partición de fases y solubilidad de lípidos
      2. Extracción de lípidos totales
      3. Separación y análisis de lípidos
  5. Parte IV – Estudio Funcional de Proteínas
    1. Capítulo 11. Interacción proteína-proteína
      1. Estudio in silico de interacciones proteína-proteína
      2. Técnicas de screening
      3. Técnicas de confirmación in vivo
    2. Capítulo 12. Calorimetría de titulación isotérmica
      1. Termodinámica de la asociación entre ligandos y macromoléculas
      2. Aspectos experimentales
      3. Características termodinámicas de la interacción ligando-macromolécula
    3. Capítulo 13. Microscopía óptica
      1. Fundamentos y fundamentos técnicos relacionados

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